@MASTERSTHESIS{ 2013:1889386705,
 	title = {Caracterização da microbiota bacteriana da água do Rio Negro em diferentes períodos sazonais},
 	year = {2013},
 	url = "http://tede.ufam.edu.br/handle/tede/5284",
 	abstract = "A comunidade de microrganismos do sistema aquático dos rios Solimões e
 Negro, bem como a diversidade destes ecossistemas não foram exaustivamente
 estudadas até o momento. O objetivo deste trabalho foi caracterizar a microbiota
 bacteriana do rio Negro em relação a sazonalidade, tanto em seu aspecto
 quantitativo (contagem de Unidades Formadoras de Colônias - UFCs) e no
 qualitativo (identificação taxonômica via sequenciamento do DNA codificador do
 RNA de pequena subunidade ribossomal SSU-rRNA). Amostras de água do rio
 Negro foram coletadas em cinco diferentes pontos, em 4 profundidades e em 5
 datas de diferentes épocas do ano, sendo que de todas amostras as UFCs foram
 contadas. O DNA total foi extraído da biomassa contida na água do rio Negro em
 períodos de cheia (RN2) e vazante (RN3) e analisado espectrofotometricamente e
 por eletroforese em gel de agarose 0,8%. Foram amplificadas as regiões variáveis
 V3 e V4 do SSU-rRNA por PCR (Reação em Cadeia da DNA Polimerase) e os
 amplicons foram sequenciados por pirosequenciamento utilizando o equipamento
 454 (Roche®). Os arquivos brutos das bibliotecas RN2 e RN3 do Rio Negro foram
 submetidas à suíte do programa Mothur para o controle de qualidade, alinhamento
 das sequências, cálculo das distâncias genéticas e definição das Unidades
 Taxonômicas Operacionais – OTUs, além de, estimativa da riqueza e diversidade
 das espécies. Pela contagem de UFCs foi possível comparar o número de bactérias
 cultiváveis nos diferentes pontos de coleta e em função da sazonalidade. Pela
 análise molecular verificou-se que o filo Proteobacteria mostrou-se dominante nestas
 duas coletas do rio (cheia e vazante), os gêneros dominantes deste filo na cheia
 foram Limnohabitans, Methylomonas, e outro filo expressivo foi Acidobacteria do
 gênero Gp3. No período de vazante os gêneros abundantes foram Polynucleobacter,
 Acinetobacter e Curvibacter, dentro do filo Proteobacteria. As curvas de rarefação
 demonstraram que a biblioteca RN3 é mais diversa em número de espécies do que
 a biblioteca RN2 e confirmado pelo índice de Shannon e InvSimpson. Pode-se
 observar a partir dos índices de ACE e Cha 1 que a biblioteca RN3 é mais rica em
 espécies comparada com a RN2.",
 	publisher = {Universidade Federal do Amazonas},
 	scholl = {Programa de Pós-Graduação em Biotecnologia},
 	note = {Instituto de Ciências Biológicas}
}