@MASTERSTHESIS{ 2021:110954316, title = {Caracteriza??o do viroma fecal do sauim-de-coleira, Saguinus bicolor (Primates: Callitrichidae), de vida livre}, year = {2021}, url = "https://tede.ufam.edu.br/handle/tede/8991", abstract = "As perturba??es antropog?nicas em ambientes naturais est?o levando a diversas altera??es na ecologia global das doen?as, com ?nfase para aquelas de origem viral. O estudo dos v?rus que ocorrem na fauna selvagem ? de suma import?ncia, pois diversas doen?as de interesse para a sa?de p?blica s?o de origem zoon?tica, sendo os primatas reservat?rios de uma gama desses v?rus. Com o advento de novas tecnologias, como o sequenciamento massivo (HTS ? do ingl?s high throughput sequencing), os viromas de diversas esp?cies de animais selvagens est?o sendo caracterizados, entretanto, ainda s?o escassos os trabalhos neste contexto de primatas selvagens brasileiros. O sauim-de-coleira (Saguinus bicolor), primata Criticamente Amea?ado e end?mico do Amazonas, possui popula??es inseridas em uma ?rea com crescente urbaniza??o e intensa fragmenta??o florestal, al?m de habitar ?reas sobrepostas com outras esp?cies de primatas, como o mico-de-cheiro (Saimiri sciureus). Diante disto, ? importante conhecer a composi??o da microbiota viral desses animais, como uma estrat?gia de vigil?ncia precoce importante no contexto da sa?de ?nica e da conserva??o das esp?cies. Os objetivos deste trabalho foram: (a) Investigar o viroma fecal de Saguinus bicolor de fragmentos florestais de Manaus; (b) Comparar a riqueza e diversidade do viroma de um grupo de Saguinus bicolor e de um grupo de Saimiri sciureus, inseridos no mesmo fragmento florestal. Realizada a coleta de conte?do fecal de nove grupos de sauins-de-coleira de vida livre de fragmentos de Manaus, as amostras de cada grupo foram reunidas para compor um pool, seguido pelo sequenciamento massivo e utiliza??o de dois m?todos de bioinform?tica (BLASTx e Kraken) para a caracteriza??o do viroma a n?vel de fam?lias virais, com ?nfase em v?rus de import?ncia para mam?feros. Os dados gerados pelo Kraken foram utilizados para normaliza??o. Os m?todos de bioinform?tica apresentaram grande diverg?ncia, sendo o Kraken a ferramenta que identificou em n?vel de fam?lias virais a maior diversidade de v?rus, inclusive daqueles de import?ncia para mam?feros (29 fam?lias dos dados brutos), enquanto o BLASTx identificou apenas cinco fam?lias. Os dados gerados pelo Kraken mostraram que muitas das comunidades virais foram distintas entre os grupos, sugerindo que a composi??o do viroma desses animais pode estar relacionada com diversas vari?veis, desde individuais at? ambientais. No cap?tulo seguinte, foi feita a coleta de esfrega?os retais e amostras fecais de um grupo de Saguinus bicolor e de um grupo de Saimiri sciureus, seguido pelo sequenciamento massivo e caracteriza??o do viroma a n?vel de fam?lias de v?rus de import?ncia para mam?feros. O grupo de sauins-de-coleira apresentou maior riqueza de fam?lias virais de import?ncia para mam?feros, apresentando ap?s normaliza??o dos dados um total de 18 fam?lias, enquanto os micos-de-cheiro apresentaram 16 fam?lias, com compartilhamento de 12 fam?lias virais para ambos os grupos. O material fecal mostrou maior riqueza quando comparado aos esfrega?os retais. Os viromas dos grupos de primatas estudados mostraram que esses animais podem abrigar uma grande variedade de fam?lias virais de import?ncia para infec??es de mam?feros. Diante disso, ? necess?rio realizar o aprofundamento das pesquisas nessas fam?lias virais para verificar se os v?rus que est?o ocorrendo nesses animais s?o de import?ncia patog?nica para a conserva??o da esp?cie e para a sa?de p?blica.", publisher = {Universidade Federal do Amazonas}, scholl = {Programa de P?s-gradua??o em Zoologia}, note = {Instituto de Ci?ncias Biol?gicas} }