@MASTERSTHESIS{ 2025:1136067074, title = {Diagnóstico de Esporotricose: Reações de Detecção (PCR) e Diferenciação (PCR- RFLP) de Espécies de Sporothrix spp.}, year = {2025}, url = "https://tede.ufam.edu.br/handle/tede/11129", abstract = "A esporotricose é uma micose subcutânea emergente de relevância na região Amazônica, com aumento expressivo de casos em humanos e felinos. A identificação rápida e precisa dos agentes etiológicos é essencial para o manejo clínico e a vigilância epidemiológica. Este estudo teve como objetivo aprimorar o diagnóstico molecular da esporotricose, avaliando diferentes métodos de extração de DNA e comparando a sensibilidade de três regiões-alvo do DNA ribossomal (ITS, ITS/LSU e D1/D2 do 28S) para amplificação por PCR. Três protocolos de extração de DNA (fenol-clorofórmio, colunas de sílica e precipitação por sal) foram aplicados a isolados de Sporothrix brasiliensis, S. schenckii, um isolado regional de Sporothrix spp., além de Candida albicans e Aspergillus niger como controles externos. O método de fenol- clorofórmio apresentou maior rendimento e pureza de DNA. Os primers ITS1–ITS4 foram os mais sensíveis, detectando até 0,0002 ng de DNA, seguidos por NL1–NL4 (0,002 ng) e ITS5– NL4 (0,02 ng). Uma análise in silico avaliou cinco enzimas de restrição (HaeIII, MspI, HinfI, DdeI e RsaI), mas os perfis de fragmentação gerados pelas diferentes espécies de Sporothrix apresentaram tamanhos muito semelhantes, com diferenças menores que 20 pb, dificultando a diferenciação prática por PCR-RFLP. Experimentalmente, a PCR-RFLP permitiu distinguir os isolados de Sporothrix dos fungos não relacionados (C. albicans e A. niger), mas não foi eficaz para diferenciar entre S. brasiliensis e S. schenckii. A análise filogenética baseada na região ITS confirmou que todos os isolados clínicos de Manaus pertenciam ao clado de S. brasiliensis. Conclui-se que a combinação da extração por fenol-clorofórmio e PCR com primers ITS1– ITS4 representa uma alternativa sensível e acessível para o diagnóstico da esporotricose na região Amazônica.", publisher = {Universidade Federal do Amazonas}, scholl = {Programa de Pós-graduação em Ciências Farmacêuticas}, note = {Faculdade de Ciências Farmacêuticas} }