@MASTERSTHESIS{ 2013:375644688, title = {Estimativa da variabilidade gen?tica da pira?ba negra Brachyplatystoma capapretum (Siluriformes: Pimelodidae), por meio de marcadores mitocondriais e microssat?lites.}, year = {2013}, url = "http://tede.ufam.edu.br/handle/tede/2234", abstract = "A larga comercializa??o dos grandes bagres migradores amaz?nicos iniciou-se em meados d?cada de 70 com o aumento dos incentivos fiscais na abertura de novos portos de desembarque pesqueiro e frigor?ficos locais. A pira?ba preta (Brachyplatystoma capapretum) comp?e uma das esp?cies de bagres amaz?nicas largamente comercializadas, compartilhando sua captura com a pira?ba (Brachyplatystoma filamentosum), devido a dif?cil discrimina??o dos seus caracteres morfol?gicos. Esta disserta??o divide-se em dois cap?tulos no formato de artigos cient?ficos. No cap?tulo I foram desenvolvidos 24 locos microssat?lites por bibliotecas gen?micas enriquecidas e testado sua amplifica??o nas demais esp?cies do g?nero Brachyplatystoma. Apenas tr?s locos foram monom?rficos nas amplifica??es em 26-38 indiv?duos de B.capapretum. O n?mero de alelos por loco variou de 1 ? 12 e valores na heterozigosidade observada e esperada variaram de 0.02 ? 0.93, e 0.08 ? 0.81, respectivamente. Tr?s locos apresentaram desvio de HWE e foi sugerida a presen?a de alelos nulos em outros seis locos microssat?lites. Na amplifica??o heter?loga, locos monom?rficos esp?cie-espec?ficos (BC04 e BC06) apresentaram polimorfismo nas demais esp?cies. Estes locos desenvolvidos podem servir de ferramentas para posteriores estudos de gen?tica de popula??es nas demais esp?cies do g?nero Brachyplatystoma. No cap?tulo II foram descriminados geneticamente 194 indiv?duos de Brachyplatystoma pertencentes a cinco esp?cies de bagres comerciais (B.filamentosum, B.capapretum, B.rousseauxii, B.vaillantii e B.platynemum). A an?lise da estrutura populacional foi inferida por marcadores mitocondriais (regi?o controle) com base em 186 exemplares de B.capapretum provenientes de nove localidades amaz?nicas. Foram sequenciados 914 pb da regi?o controle do DNAmt onde se observou 75 hapl?tipos e 58 hapl?tipos ?nicos. A m?dia da diversidade haplot?pica (HD) foi de 0,939 e diversidade nucleot?dica (?) de 0,0034. Posteriormente, 164 indiv?duos de B.capapretum foram genotipados com base em oito locos microssat?lites, selecionados de acordo com sua efici?ncia de amplifica??o e conte?do de polimorfismo. Agrupamentos significantes para as localidades do rio Purus e Rio Madeira foram evidenciados pela AMOVA dos dados mitocondriais, onde 12,03% da varia??o gen?tica estavam contidas nesses tribut?rios, quando comparados ?s demais localidades. Outros agrupamentos tamb?m foram revelados atrav?s dos oitos locos microssat?lites, onde o Rio Branco apresentou valores significativos de FST e baixos n?meros de migrantes. Contudo, as an?lises Bayesianas para estrutura populacional em ambos os marcadores n?o descartam a hip?tese de panmixia nas popula??es de B.capapretum, sendo observadas fortes tend?ncias ao fluxo g?nico entre as localidades. Os resultados obtidos foram contextualizados nas principais mudan?as geol?gicas ocorridas na bacia Amaz?nica e enfocado medidas conservacionistas para B.capapretum.", publisher = {Universidade Federal do Amazonas}, scholl = {Programa de P?s-Gradua??o em Biotecnologia}, note = {Instituto de Ci?ncias Biol?gicas} }