@PHDTHESIS{ 2009:1362865802, title = {An?lise da diversidade bacteriana dos Rios Negro e Solim?es pela abordagem metagen?mica}, year = {2009}, url = "http://tede.ufam.edu.br/handle/tede/4707", abstract = "Este estudo comparou a estrutura dc comunidades bacterianas dos rios Solimoes e Negro, baseada na an?lise do gene rRNA 168. 0 DNA total foi extraido depois da ?ltraeio da ?gua atrav?s dos ?ltros de 0.8pM e 0.22uM, respectivamente. 0 gene rRNA 168 foi ampli?cado por PCR. clonado e seqiienciado. e as seqii?ncias foram analisadas pelos programas PHYLIP e DOTUR para obtengio das OTUs. e c?lculo dos indices de diversidade e riqueza pelo programa SPADE. A a?liaqio taxon?mica foi feita pela submiss?o das seq??ncias aos programas BLASTn e naive Bayesian rRNA Classi?er do RDP II (Ribosomal Database Project). A ?rvore ?logen?tica foi construfda pelo m?todo Neighbor Joining pelo programa Mega, vers?o 4. 0s resultados mostraram uma vasta riqueza de 01' Us bacterianas, nos dois ambientes. O rio Solim?es apresentou maior diversidade de g?neros bacterianos. enquanto na biblioteca do do Negro, embora menos diverso, foi encontrada uma maior concentraqio de OTUs penencentes a um g?nero bacteriano especf?co, Polynucleobacter, acenando para uma investigaqio mais incisiva no intuito de se entender o papel desempenhado por essas bact?rias nesses ambientes ainda pouco explorados.", publisher = {Universidade Federal do Amazonas}, scholl = {Programa de P?s-Gradua??o em Biotecnologia}, note = {Instituto de Ci?ncias Biol?gicas} }