@PHDTHESIS{ 2015:1938633282, title = {Desenvolvimento de um sistema multiplex mini-STR de cromossomo y e an?lise das frequ?ncias haplot?picas na popula??o da cidade de Manaus}, year = {2015}, url = "http://tede.ufam.edu.br/handle/tede/5217", abstract = "Metodologias para an?lise molecular relacionadas com estudos populacional e forense, t?m sido desenvolvidas a partir de marcadores de microssat?lites (STRs) e as aplica??es desses marcadores, potencialzam os sistemas de amplifica??o por PCR, seja utilizando apenas um par de STRs (monoplex) ou v?rios STRs (multiplex). Para a identifica??o humana por DNA, os primeiros sistemas multiplex foram estabelecidos com STRs de cromossomos autossom?micos, seguidos do uso de STRs de tamanho reduzido, conhecidos como Mini- STRs. Posteriormente, para o cromossomo Y, foram desenvolvidos os Y-STRs, os Mini-YSTRs e mais recentemente o uso dos YSTR de muta??o r?pida (RM)-YSTR. E por n?o existirem dados com STRs do cromossomo Y na popula??o da Cidade de Manaus, o estudo com tais marcadores torna-se relevante. Assim, os objetivos deste trabalho foram desenvolver um sistema multiplex do tipo MiniY-STR para avaliar a efici?ncia na amplifica??o de amostras de casos forenses (DNA degradado) e al?m disso, em conjunto com o Kit comercial PowerPlex?Y23 System (Promega), determinar a frequ?ncia haplot?pica da popula??o da cidade de Manaus. Para tanto, foi constru?do um sistema multiplex ?in house? denominado Mini YSTR09, contendo 9 locos de Mini-YSTR e (RM)-YSTR (Cap?tulo I).Para a valida??o,foram realizados testes de sensibilidade, de detec??o em amostras com misturas e testes em amostras de DNA degradado (98 amostras de osso humano), conforme recomenda??o do SWGDAM. O multiplex foi capaz de amplificar todos os 09 (100%) locos nos sistemas de mistura de DNA e nos sistemas com amostras de DNA degradado (69,4%). Para o estudo populacional (cap?tulo II), as 214 amostras de sangue coletadas de indiv?duos do sexo masculino n?o relacionados geneticamente, foram extra?das com kits comerciais e os produtos amplificados por PCR (31 Y-STRs em tr?s grupos), foram submetidos a eletroforese capilar no sequenciador ABI 3500 e analisados no software Genemapper v. 4,1. 204 amostras foram tipadas com o kit comercial (grupo I), 189 com o Mini YSTR09 (grupo II) e 168 com o conjunto desses dois multiplexs, Kit comercial mais o Mini YSTR09 (grupo III). A presen?a de hapl?tipos ?nicos nos grupos I, II e III foi de 202, 181 e 168, respectivamente. A maior diversidade g?nica foi dos DYS626, DYS570, DYS576 e DYS447, para o grupo I; dos DYS385, DYS570, DYS458, DYS481 e DYS456 para o grupo II e DYS385, DYS461, DYS626, DYS458, DYS576, DYS447 e DYS456 para o grupo III, sendo o DYS447, dentre os mais polim?rficos quando das an?lises no grupo I e III. Portanto, a aplica??o do multiplex Mini YSTR09 aqui desenvolvido, possibiltou a amplifica??o desse DNA em quantidades m?nimas e degradado e al?m disso, para as an?lises populaconais proporcionou uma maior capacidade de discrimina??o quando foi utilizado em conjunto com o kit comercial PowerPlex? Y23 System, destacando-se os locos DYS447, DYS570, DYS576 e DYS626", publisher = {Universidade Federal do Amazonas}, scholl = {Programa de P?s-Gradua??o em Biotecnologia}, note = {Instituto de Ci?ncias Biol?gicas} }