@MASTERSTHESIS{ 2016:736763875,
 	title = {An?lise do transcriptoma de Fusarium decemcellulare agente causal do superbrotamento em guaranazeiro (Paullinia cupana var. sorbilis)},
 	year = {2016},
 	url = "http://tede.ufam.edu.br/handle/tede/5544",
 	abstract = "O guaran? da Amaz?nia ? muito apreciado por suas propriedades medicinais e energ?ticas, sendo o Amazonas a segunda contribui??o nacional na produ??o. Esta produ??o, entretanto, acaba sendo afetada por uma das principais doen?as da cultura: o superbrotamento, que tem como agente causal o fungo Fusarium decemcellulare. Os sintomas da doen?a s?o: o superbrotamento de gemas, a hiperplasia e hipertrofia floral e as galhas do caule. Em diversos estudos, associa-se sintomas semelhantes aos do superbrotamento a uma produ??o, ou ainda modula??o, do horm?nio auxina por parte do pat?geno. Assim, o objetivo deste trabalho foi de identificar genes de vias de s?ntese do horm?nio auxina em Fusarium decemcellulare e analisar diferen?as entre perfis transcript?micos de isolados homot?licos e heterot?licos. Foram sequenciadas 12 bibliotecas, referentes a seis r?plicas biol?gicas (tr?s isolados homot?licos e tr?s isolados heterot?licos de F. decemcellulare) para cada condi??o de crescimento: meios BD e MS. O controle de qualidade das reads foi realizado pelos softwares Trimmomatic-0.33, FastQC e SortMeRNA. O mapeamento de reads no genoma de refer?ncia foi realizado com o software TopHat2 e a montagem do transcriptoma final em cada condi??o, bem como o c?lculo de express?o diferencial, foram realizados atrav?s do pacote Cufflinks (Cufflinks, Cuffmerge e Cuffdiff). A anota??o funcional dos transcritos foi realizada atrav?s das ferramentas KEGG Automatic Annotation Server (KAAS) e Blast2GO. Para verificar a habilidade de F. decemcellulare em sintetizar auxina, os isolados FDC200 e CML 2241 foram crescidos em meio MS, o qual foi posteriormente analisado por meio de cromatografia l?quida de ultra performance. Foram identificados, a n?vel gen?mico e transcript?mico, duas putativas vias de s?ntese do horm?nio auxina: a via do indol-acetalde?do, mais o desvio desta via, al?m da via da triptamina. A express?o destes genes foi detectada tanto em indiv?duos heterot?licos, quanto em homot?licos. Foi identificado ainda, tamb?m a n?vel gen?mico e transcript?mico, um gene de uma putativa aminociclopropano (ACC) deaminase, respons?vel por degradar o precursor do horm?nio etileno, o ACC. Al?m disso, o horm?nio auxina foi detectado no meio de cultura MS, onde foram crescidos os isolados FDC200 e CML2241, confirmando bioss?ntese por parte do fungo. Os dados aqui obtidos sugerem, portanto, que Fusarium decemcellulare estaria se utilizando da s?ntese de auxina e bloqueio da produ??o de etileno da planta para burlar o sistema de defesa da hospedeira, sendo os sintomas do
 superbrotamento em guaranazeiro uma consequ?ncia do desequil?brio hormonal causado pelo fungo.",
 	publisher = {Universidade Federal do Amazonas},
 	scholl = {Programa de P?s-Gradua??o em Biotecnologia},
 	note = {Instituto de Ci?ncias Biol?gicas}
}