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dc.creatorPeixoto, Jean Charles da Cunha-
dc.creator.Latteshttp://lattes.cnpq.br/6421264538330799por
dc.contributor.advisor1Astolfi Filho, Spartaco-
dc.contributor.advisor1Latteshttp://lattes.cnpq.br/2699190136695057por
dc.date.issued2009-02-18-
dc.identifier.citationPEIXOTO, Jean Charles da Cunha. Análise da diversidade bacteriana dos Rios Negro e Solimões pela abordagem metagenômica. 2009. 132f. Tese (Doutorado em Biotecnologia) - Universidade Federal do Amazonas, Manaus, 2009.por
dc.identifier.urihttp://tede.ufam.edu.br/handle/tede/4707-
dc.description.resumoEste estudo comparou a estrutura dc comunidades bacterianas dos rios Solimoes e Negro, baseada na anélise do gene rRNA 168. 0 DNA total foi extraido depois da filtraeio da égua através dos filtros de 0.8pM e 0.22uM, respectivamente. 0 gene rRNA 168 foi amplificado por PCR. clonado e seqiienciado. e as seqiiéncias foram analisadas pelos programas PHYLIP e DOTUR para obtengio das OTUs. e célculo dos indices de diversidade e riqueza pelo programa SPADE. A afiliaqio taxonémica foi feita pela submissfio das seqfiéncias aos programas BLASTn e naive Bayesian rRNA Classifier do RDP II (Ribosomal Database Project). A érvore filogenética foi construfda pelo método Neighbor Joining pelo programa Mega, versfio 4. 0s resultados mostraram uma vasta riqueza de 01' Us bacterianas, nos dois ambientes. O rio Solimées apresentou maior diversidade de géneros bacterianos. enquanto na biblioteca do do Negro, embora menos diverso, foi encontrada uma maior concentraqio de OTUs penencentes a um género bacteriano especffico, Polynucleobacter, acenando para uma investigaqio mais incisiva no intuito de se entender o papel desempenhado por essas bactérias nesses ambientes ainda pouco explorados.por
dc.description.abstractThis study compared the structure of bacterial communities in the Solimoes rivers and Black, based on ANELISE rRNA gene 168. 0 Total DNA was extracted after the fi ltraeio mare through the fi lters of 0.8pM and 0.22uM respectively. 0 rRNA gene was 168 ampli fi ed by PCR. cloned and sequenced. and were analyzed by seqiiéncias PHYLIP and DOTUR programs obtengio the OTUs. and CALCULATION of diversity indices and wealth by SPADE program. The liaqio the taxonémica fi was made by the submissions of the fi seq fi ences to BLASTn programs and naive Bayesian rRNA Classi fi er II RDP (Ribosomal Database Project). The érvore fi logenética was construfda by Neighbor Joining method by Mega program, vers Fi 4. 0s results showed a vast wealth of 01 'bacterial Us, in both environments. The river Solimées showed greater diversity of bacterial genera. while in the Black library, though less diverse, it found greater concentraqio of OTUs penencentes a bacterial genus especf fi c, Polynucleobacter, waving to a stronger investigaqio in order to understand the role of these bacteria in these still unexplored environments.eng
dc.description.sponsorshipConselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPqpor
dc.formatapplication/pdf*
dc.thumbnail.urlhttp://tede.ufam.edu.br//retrieve/13122/Reprodu%c3%a7%c3%a3o%20N%c3%a3o%20Autorizada.pdf.jpg*
dc.languageporpor
dc.publisherUniversidade Federal do Amazonaspor
dc.publisher.departmentInstituto de Ciências Biológicaspor
dc.publisher.countryBrasilpor
dc.publisher.initialsUFAMpor
dc.publisher.programPrograma de Pós-Graduação em Biotecnologiapor
dc.rightsAcesso Embargadopor
dc.subjectBacia Amazônicapor
dc.subjectRio Solimõespor
dc.subjectRio Negropor
dc.subject.cnpqCIÊNCIAS BIOLÓGICASpor
dc.titleAnálise da diversidade bacteriana dos Rios Negro e Solimões pela abordagem metagenômicapor
dc.typeTesepor
Appears in Collections:Doutorado em Biotecnologia

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