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???metadata.dc.type???: Tese
Title: Determinantes genéticas em genes de interleucinas e suas possíveis associações com o risco no desenvolvimento de periodontite: resultados de metanálises convencionais e com abordagem Bayesiana
???metadata.dc.creator???: Silva, Felipe Rodolfo Pereira da 
???metadata.dc.contributor.advisor1???: Barcellos, José Fernando Marques
???metadata.dc.description.resumo???: A periodontite é uma doença inflamatória que possui elevada prevalência na clínica odontológica o qual sua fisiopatologia é marcada pela atuação de mediadores inflamatórios que culminam com a degradação dos tecidos de suporte dental. Variações genéticas em genes de interleucinas (IL) recebem considerável atenção no contexto de fatores relacionados ao maior risco de desenvolvimento da periodontite. Tanto estudos caso/controle em polimorfismos em genes de citocinas como a IL-2 ou de moléculas participantes dos mecanismos epigenéticos como o RNA não codificador antisenso INK4 (ANRIL) ou estudos de metanálises sobre variantes gênicas na IL1A, 1B, 1RN, 4, 6, dentre outras que buscam determinar a associação com a periodontite. Contudo, resultados contraditórios sobre a associação entre polimorfismos nos genes IL2 e ANRIL estão disponíveis na literatura bem como a possibilidade de achados falso-positivos nas metanálises acerca de polimorfimos em genes de IL e o risco de periodontite. Assim, visto tais achados, este estudo objetiva realizar metanálises sobre variações genéticas no IL2 e ANRIL e revalidar os achados de metanálises sobre polimorfismos em genes de IL e periodontite crônica por meio de abordagem Bayesiana. Para isso uma busca sistemática em bases dados específicas foi realizada para estudos publicados anteriormente a 2019 seguindo critérios de inclusão para os estudos. Os dados foram extraídos dos artigos inclusos com posterior avaliação estatística por meio dos softwares Review Manager e Comprehensive Meta-analysis com cálculos de heterogeneidade (I²), Odds Ratio (OR) e os testes de viés de publicação com auxílio do gráfico de Funnel-plot. Para todas as avaliações, o valor de P<0,05 foi considerado significativo. Na abordagem Bayesiana os cálculos da taxa de probabilidade falso-positivo (FPRP) e a probabilidade Bayesiana de descoberta falsa (BFDP) foram realizados para detectar a notoriedade dos achados das metanálises disponíveis na literatura com valor de P<0,02 para FPRP e P<0,08 para BDFP. Como resultados foram encontrados cinco estudos para o polimorfismo -330 T/G no gene IL2 e periodontite crônica, 12 estudos para o polimorfismo rs1333048 no gene ANRIL e periodontite e 9 estudos de metanálise sobre diferentes polimorfismos em genes de interleucinas. Não houve associação significativa para o polimorfismo no gene IL2 e o risco de periodontite (OR=2,07, P=0,15) mas uma associação significativa entre o polimorfismo no gene ANRIL e o risco da doença (OR=1,24, P<0,00001). Dentre todas as variantes genéticas apresentadas nas metanálises submetidas à abordagem Bayesiana, somente os polimorfismos rs1800587 na IL1A e rs1143634 no gene IL1B foram “dignos de nota”. Em conclusão este trabalho evidenciou a relação entre os polimorfismos nos genes IL2 e ANRIL com a periodontite, bem como a revalidação dos dados sobre metanálises focando nos polimorfismos nos genes IL1A e 1B com o risco de desenvolvimento de periodontite demonstrando essas variações como biomarcadores de susceptibilidade para a doença.
Abstract: Periodontitis is an inflammatory disease with a high prevalence in dentistry, which its pathophysiology is characterized by the role of inflammatory mediators that culminates in a degradation of the support tissues around the teeth. Genetic variations in interleukin (IL) genes receive attention in the context of factors related with the increased risk of periodontitis developing. Both case studies / control of polymorphisms in cytokine genes such as IL-2 or molecules participating in epigenetic mechanisms such as the INK4 antisense non-coding RNA (ANRIL) or meta-analysis studies on IL1A, 1B, 1RN, 4, 6 genetic variants among other that determine the association with periodontitis. However, contradictory results on the association between polymorphisms in the IL2 and ANRIL genes are available in the literature, as well as the likelihood of false-positive findings in the analyses on polymorphisms in the IL genes and risk of periodontitis. Thus, in view of these findings, the aim of this study is to perform meta-analyses on genetic data on IL2 and ANRIL and validates the findings on polymorphisms in IL genes and chronic periodontitis through the Bayesian approach. For this, a systematic search of databases was carried out for studies previously published in 2019 following the inclusion of studies. Data were extracted from included articles with subsequent statistical assessment using the Review Manager and Comprehensive Meta-Analysis software with heterogeneity calculations (I²), Odds Ratio (OR) and the publication bias tests with Funnel-plot graphic. In all evaluations, the value of P<0.05 was considered as significant. In the Bayesian approach, calculations of False Positive Rate Probability (FPRP) and Bayesian False Discovery Probability (BFDP) were performed to detect the noteworthiness of the findings from the meta-analyzes available in the literature with a value of P<0.02 for FPRP and P<0.08 for BDFP. As results, five studies were found for the -330 T/G polymorphism in the IL2 gene and chronic periodontitis, 12 studies for the rs1333048 polymorphism in the ANRIL gene and periodontitis and 9 meta-analysis studies on different polymorphisms in the IL genes. There was no significant association for the polymorphism in the IL2 gene and the risk of periodontitis (OR = 2.07, P = 0.15), but a significant association between the polymorphism in the ANRIL gene and the risk of disease (OR = 1.24, P<0.00001). All the genetic variants used in the analyses submitted to the Bayesian approach, including the polymorphisms rs1800587 in IL1A and rs1143634, no IL1B genes were "noteworthy". In conclusion, this study showed the relationship between polymorphisms in the IL2 and ANRIL genes with periodontitis, as well as the revalidation of data on meta-analyses focused on polymorphisms in the IL1A and 1B genes with the risk of developing periodontitis demonstrating those as biomarkers for the susceptibility to the disease.
???metadata.dc.subject.cnpq???: CIÊNCIAS DA SAÚDE: ODONTOLOGIA: PERIODONTIA
CIÊNCIAS BIOLÓGICAS: GENÉTICA: GENÉTICA HUMANA E MÉDICA
CIÊNCIAS BIOLÓGICAS: IMUNOLOGIA: IMUNOGENÉTICA
???metadata.dc.subject.user???: Citocinas
Doença periodontal
Alelos
Odds Ratio
Variação genética
Language: por
???metadata.dc.publisher.country???: Brasil
Publisher: Universidade Federal do Amazonas
???metadata.dc.publisher.initials???: UFAM
???metadata.dc.publisher.department???: Instituto de Ciências Biológicas
???metadata.dc.publisher.program???: Programa de Pós-graduação em Imunologia Básica e Aplicada
Citation: SILVA, Felipe Rodolfo Pereira da. Determinantes genéticas em genes de interleucinas e suas possíveis associações com o risco no desenvolvimento de periodontite: resultados de metanálises convencionais e com abordagem Bayesiana. 2020. 135 f. Tese ( Doutorado em Imunologia Básica e Aplicada) - Universidade Federal do Amazonas, Manaus, 2020.
???metadata.dc.rights???: Acesso Aberto
URI: https://tede.ufam.edu.br/handle/tede/7983
Issue Date: 12-Jun-2020
Appears in Collections:Doutorado em Imunologia Básica e Aplicada

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