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Use este identificador para citar ou linkar para este item: https://tede.ufam.edu.br/handle/tede/4707
Tipo do documento: Tese
Título: Análise da diversidade bacteriana dos Rios Negro e Solimões pela abordagem metagenômica
Autor: Peixoto, Jean Charles da Cunha 
Primeiro orientador: Astolfi Filho, Spartaco
Resumo: Este estudo comparou a estrutura dc comunidades bacterianas dos rios Solimoes e Negro, baseada na anélise do gene rRNA 168. 0 DNA total foi extraido depois da filtraeio da égua através dos filtros de 0.8pM e 0.22uM, respectivamente. 0 gene rRNA 168 foi amplificado por PCR. clonado e seqiienciado. e as seqiiéncias foram analisadas pelos programas PHYLIP e DOTUR para obtengio das OTUs. e célculo dos indices de diversidade e riqueza pelo programa SPADE. A afiliaqio taxonémica foi feita pela submissfio das seqfiéncias aos programas BLASTn e naive Bayesian rRNA Classifier do RDP II (Ribosomal Database Project). A érvore filogenética foi construfda pelo método Neighbor Joining pelo programa Mega, versfio 4. 0s resultados mostraram uma vasta riqueza de 01' Us bacterianas, nos dois ambientes. O rio Solimées apresentou maior diversidade de géneros bacterianos. enquanto na biblioteca do do Negro, embora menos diverso, foi encontrada uma maior concentraqio de OTUs penencentes a um género bacteriano especffico, Polynucleobacter, acenando para uma investigaqio mais incisiva no intuito de se entender o papel desempenhado por essas bactérias nesses ambientes ainda pouco explorados.
Abstract: This study compared the structure of bacterial communities in the Solimoes rivers and Black, based on ANELISE rRNA gene 168. 0 Total DNA was extracted after the fi ltraeio mare through the fi lters of 0.8pM and 0.22uM respectively. 0 rRNA gene was 168 ampli fi ed by PCR. cloned and sequenced. and were analyzed by seqiiéncias PHYLIP and DOTUR programs obtengio the OTUs. and CALCULATION of diversity indices and wealth by SPADE program. The liaqio the taxonémica fi was made by the submissions of the fi seq fi ences to BLASTn programs and naive Bayesian rRNA Classi fi er II RDP (Ribosomal Database Project). The érvore fi logenética was construfda by Neighbor Joining method by Mega program, vers Fi 4. 0s results showed a vast wealth of 01 'bacterial Us, in both environments. The river Solimées showed greater diversity of bacterial genera. while in the Black library, though less diverse, it found greater concentraqio of OTUs penencentes a bacterial genus especf fi c, Polynucleobacter, waving to a stronger investigaqio in order to understand the role of these bacteria in these still unexplored environments.
Palavras-chave: Bacia Amazônica
Rio Solimões
Rio Negro
Área(s) do CNPq: CIÊNCIAS BIOLÓGICAS
Idioma: por
País: Brasil
Instituição: Universidade Federal do Amazonas
Sigla da instituição: UFAM
Departamento: Instituto de Ciências Biológicas
Programa: Programa de Pós-Graduação em Biotecnologia
Citação: PEIXOTO, Jean Charles da Cunha. Análise da diversidade bacteriana dos Rios Negro e Solimões pela abordagem metagenômica. 2009. 132f. Tese (Doutorado em Biotecnologia) - Universidade Federal do Amazonas, Manaus, 2009.
Tipo de acesso: Acesso Embargado
URI: http://tede.ufam.edu.br/handle/tede/4707
Data de defesa: 18-Fev-2009
Aparece nas coleções:Doutorado em Biotecnologia

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